Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Scara5Q8K299 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scara5Q8K299 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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