Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms