Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SbsnQ8CIT9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms