Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdc34Q8CFI2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdc34Q8CFI2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms