Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx16Q8C080 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms