Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ube3dQ8BX13 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ube3dQ8BX13 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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