Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms