Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca8Q8BHX3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms