Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg4bQ8BGE6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms