Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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ChfrQ810L3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChfrQ810L3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms