Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrfn4Q80XU8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrfn4Q80XU8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrfn4Q80XU8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lrfn4Q80XU8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lrfn4Q80XU8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lrfn4Q80XU8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lrfn4Q80XU8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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