Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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