Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rad54bQ6PFE3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rad54bQ6PFE3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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