Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SvoplQ6PDF3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms