Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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