Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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