Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca2Q6DIC0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms