Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fbxo27Q6DIA9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms