Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pram1Q6BCL1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms