Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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