Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Atg9aQ68FE2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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