Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms