Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc2Q62029 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms