Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nell2Q61220 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms