Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms