Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms