Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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