Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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