Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms