Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms