Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms