Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms