Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms