Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RubcnlQ3TD16 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms