Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hddc2Q3SXD3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hddc2Q3SXD3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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