Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ptcd3Q14C51 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ptcd3Q14C51 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms