Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gli2Q0VGT2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gli2Q0VGT2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms