Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms