Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LyarQ08288 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LyarQ08288 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LyarQ08288 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LyarQ08288 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms