Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col9a2Q07643 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms