Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gdf3Q07104 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gdf3Q07104 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gdf3Q07104 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gdf3Q07104 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms