Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RykQ01887 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RykQ01887 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RykQ01887 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms