Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mc1rQ01727 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms