Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms