Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms