Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gbp10Q000W5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms