Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcc1P97496 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms