Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps3aP97351 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms