Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms