Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbdsP70122 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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